程序的副作用
部分人士或有機會出現脂肪增生 可能影響皮膚外觀
一般而言，接受程序後，經過處理的皮膚範圍會感到寒冷、僵硬、麻痺、泛紅、腫脹，這些情況一般會在數小時內消退；而紅斑（erythema）、瘀傷（bruising）、麻痺（numbness）、疼痛和刺痛的感覺可能需要數天至數星期才能完全退散。
少數提供服務的商戶有於其網頁說明這些接受程序後常見的副作用。而在本會職員的查詢過程中，大部分美容中心都只粗略說明上述較輕微的副作用。
不過，美國皮膚科醫學會的資料顯示，即使接受冷凍溶脂程序可能出現副作用的機會相對較低，但仍有皮膚表面不平（surface irregularities）和不對稱（asymmetry）的風險。接受程序人士或未必可以得到預期的效果，例如少數人士或可能出現脂肪細胞增生（paradoxical adipose hyperplasia，簡稱PAH）等較罕見的副作用。
另一方面，亦有研究文獻提出，如果接受冷凍程序的為下頜位置（即雙下巴部位），有個案出現下頜緣神經麻痺（marginal mandibular nerve paresis），於程序後3個月才消退。另有個案出現間歇性劇烈的耳痛，需要用藥物緩和；亦有人出現舌頭刺痛的感覺。更有報告指出，接受程序的皮膚部位可能出現色素沉澱（hyperpigmentation），相信與過程中儀器探頭吸住皮膚引致血管變化有關。儘管脂肪細胞增生和炎症後色素沉澱問題都屬於較罕見的副作用，但前者或需以抽脂（liposuction）或切除（excision）方法處理，而色素問題可能需要6至12個月甚或更長時間來處理。
海外較嚴重副作用事件簿:
嚴重凍傷
2020年瑞士一份整形、重建和美容手術期刊報告指出，有涉及在非醫學美容中心接受冷凍溶脂程序後出現嚴重凍傷併發症的醫療病例個案。一名年約60歲女士在接受了50分鐘的「冷凍溶脂」程序數小時後，接受程序處理的左腹範圍皮膚出現紅腫、長出水泡，受影響範圍與儀器探頭的尺寸相約。該女士其後雖然按美容中心指示服食止痛藥及護理傷口，但傷口情況轉差，需要到急症室求醫。求醫時傷口面積約為15x12厘米，皮膚呈紫色，水泡更流出液體。相關診斷結果顯示，該範圍皮膚中央位置出現全層凍傷（full-thickness frostbite），而周邊則為表層凍傷。需要住院及經過多次手術清理傷口，才可以進行整形手術縫合傷口。整形手術一年後，該部位仍有明顯疤痕以及腹壁畸形（abdominal wall deformity），影響外觀。該報告指出，儘管冷凍溶脂的副作用大多屬於輕微並可自行消退，但仍有機會造成嚴重的永久性影響，例如輪廓不規則（contour irregularities）、不對稱、皮膚萎縮（cutaneous atrophy），出現色斑（dyschromia）和脂肪異常增生等。該研究估計，程序所用的儀器並沒有獲得美國食品及藥物管理局（FDA）許可，而負責的美容師亦未有熟習儀器的操作。
脂肪組織異常增生
2014年，美國一份醫療病例報告指出，一名年約40歲男士接受了1次「冷凍溶脂」程序來處理其腹部贅肉。程序後只出現紅斑、輕微不適感覺，而在接受程序1至2個月後，男士見到經過處理的部位脂肪體積有顯著減少。不過，於接受程序約3個月後，該男士發現其體重雖然沒有顯著增加，但經處理的部位有非柔軟的組織增生，而位置和形狀與儀器探頭十分吻合。經過診斷，發現該長方形、邊界清晰的皮下軟組織為局部脂肪組織增生。而該報告更指出，儘管男性在接受相關程序後出現脂肪組織增生的機會較高，但在已知的個案中，亦有不少女性病人出現相關情況。
硬斑病
2019年美國皮膚病學會公布的醫療病例報告亦指出，有個案涉及一名年約67歲女士在非醫學美容中心接受一次「冷凍溶脂」程序後出現硬斑病（morphea）。其下腹及大腿部位經過60分鐘的冷凍程序，而在接受程序6星期後，相關部位分別出現多個硬化和增厚的硬塊（firm and thickened sclerotic plaques）。經診斷懷疑是因為程序所引發的炎症反應，導致硬塊的形成。
